Michael Wagner führt ein Büro für Architektur und Städtebau in Zürich und ist Professor für Architektur und Städtebau an der Universität Liechtenstein. Ein Schwerpunkt seiner Arbeit liegt auf der nachhaltig regenerativen Entwicklung der gebauten und nicht gebauten Umwelt. Dabei bewegt er sich an den Schnittstellen von Architektur, Städtebau und Raumentwicklung.

Von 2018 bis 2023 hat er die Städtebau-Vorlesungen im Bachelor-Studiengang am Departement Architektur der ETH Zürich gehalten. Von 2010 bis 2018 war er Assistent und Oberassistent an der Professur Kees Christiaanse und leitete den Forschungsschwerpunkt Kulturlandschaft.

Michael Wagner beteiligt sich regelmässig an Forschungsprojekten und publiziert in den Bereichen Architektur, Städtebau und Raumentwicklung. 2014 war er Gastprofessor Agenda Lehre an der TU München, 2017/18 Gastdozent für Städtebauliches Entwerfen an der Universität Liechtenstein.

Vor kurzem wurden der Neubau des Recyclingzentrums der Stadt Zug und die Wohnüberbauung Klosterstrasse abgeschlossen, mehrere Studien und Umbauprojekte sind in Bearbeitung. Seit 2018 begleitet er die Stadt Lichtensteig in räumlichen Entwicklungsfragen, die 2023 vom Schweizer Heimatschutz den Wakkerpreis erhalten hat.

Er ist unter anderem Co-Autor der Studie Urban densification and its impact on energy use in Swiss cities, die 2020/21 im Auftrag des Schweizerischen Bundesamts für Energie durchgeführt wurde, und der Schlussberichte Aktionsplan und Leitfaden des KTI-geförderten Forschungsprojekts Zernez Energia 2020. Sein Interesse gilt den energetischen Konsequenzen und den Umweltauswirkungen städtebaulicher Entwicklung, um daraus Erkenntnisse für die zukünftige Städtebaupraxis zu gewinnen.